污泥中有许多染物，污染物有害健康。但污泥中污染物的类型、浓度、致病机理、污染途径、对人类健康和自然环境的损害如何，目前尚不为大众所知。
污泥危害更隐蔽、直接、且难治理消除，污水中的污染物绝大部分被浓缩在污泥中。无论污水、废气、垃圾还是污泥，都是可能引发环境问题的污染源。从污染当量看，污泥的问题并不比垃圾小，甚至可以说，这种污水处理所形成的浓缩物质，其污染程度有时候可能比垃圾的危害还要大。
垃圾很少会被成千吨地大规模弃置在环境中；而污泥常常被大规模弃置在河湖、堤岸、沟壑、田地中。高含水率的特点，使得污泥中的污染物可能被雨水冲入水体，通过土壤污染地下水，散发的气味和挥发性有机物会污染周边空气，同时还会造成局部土壤的污染物浓度提高。从这个角度看，较之垃圾，污泥对环境所产生的危害看似更为隐蔽，实则更直接、更难治理消除。
抛开纯粹的工业污泥不谈，仅就城镇污水处理厂所产生的市政污泥而言，其潜在的污染能力不容小觑。城镇居民生活会将各种各样的污染物带入污水中，而污水中污染物的绝大部分又都被浓缩在了污泥中。
生活中的食品、药品中含有的各种重金属、农药残留、难降解有机物会随人类排泄物进入污水；人们消费的各种日用化工品如香水、洗涤剂、护理用品中的有机化合物会被洗入水中；人居环境中，洁厕灵、空气清新剂、杀虫剂、油漆等溶剂中的各种有机化合物的归宿仍然是水；各种交通工具排放的废气以及轮胎磨损所释放的污染物，终也会被雨水冲刷到下水道中。
间接服务于城镇居民生活的各种市政设施，也会将各种污染物排入城市的污水管道:采暖设施燃料燃烧释放的废气，城市垃圾收集转运和处理过程中产生的渗滤液，电池腐蚀后流出的电解液，火电厂的燃烧废气，焚烧厂的废气，废旧变压器的废液，医院和牙科诊所排入下水道的消毒
剩余污泥(excessactivatedsludge)活性污泥系统中从二次沉淀池（或沉淀区）排出系统外的活性污泥。剩余污泥的产生：在生化处理过程中，活性污泥中的微生物不断地消耗着废水中的有机物质。被消耗的有机物质中，一部分有机物质被氧化以提供微生物生命活动所需的能量，另一部分有机物质则被微生物利用以合成新的细胞质，从而使微生物繁衍生殖，微生物在新陈代谢的同时，又有一部分老的微生物死亡，故产生了剩余污泥。
剩余污泥如果不及时进行处理，会带来二次污染：
①对水体的污染：剩余污泥长期不经处理随意堆放，经雨水浸淋，渗出液和滤沥中会带出一部分氮磷以及一些重金属和有害化学物质，这些都会污染土地、河川、湖泊和地下水。
②对大气的污染：剩余污泥如果不进行及时的处理，长时间堆放，污泥会进行消化，产生沼气，污染大气。另外，干污泥和一些尘粒会随风飞扬，遇到大风，会刮到很远的地方。一些污泥本身或者在焚化时，会散发毒气和臭气。
③对土壤的污染：剩余污泥及其渗出液和滤沥所含的有害物质会改变土质和土壤结构，影响土壤中微生物的活动，有碍植物根系生长，或在植物机体内积蓄。